医保科成立于2002年，主要承担全县职工医疗保险患者在本院住院费用的审核报销、职工住院医疗保险的管理、全院职工医疗保险费用的缴纳等相关职能。

2014年元月随着县新型农村合作医疗中心与县医保局的合并，本院医保科也与新型农村合作医疗管理办公室合并，统称医保科。

目前医科室有在职职工7人，其中高级职称1人，中级职称2人，初级职称4人，主要负责：医保政策的宣传、培训；医保制度的制定与实施；医保数据的统计分析；医保审核数据的反馈和整改；执行医保服务协议；医保质量控制；职工和城乡居民医保患者住院费用审核报销；居民生育保险、离退休伤残军人住院、居民商业保险、民政救助、门诊刷卡、异地住院、精准医疗扶贫患者住院等费用报销；与上级管理机构沟通协调等业务。